Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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