Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms