Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms