Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4CQ96CF2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4CQ96CF2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms