Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPNE4Q96A23 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms