Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4BQ92750 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms