Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM9SF4Q92544 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms