Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms