Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC21AQ8NDW8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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