Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAMKVQ8NCB2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMKVQ8NCB2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms