Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms