Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms