Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKL3Q8IVW4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms