Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF554Q86TJ5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF554Q86TJ5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms