Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms