Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms