Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms