Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX8Q68G74 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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