Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms