Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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