Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms