Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms