Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA3Q53S33 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA3Q53S33 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms