Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms