Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETM2Q2VYF4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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