Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms