Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GEN1Q17RS7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GEN1Q17RS7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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GEN1Q17RS7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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