Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPROQ16827 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPROQ16827 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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