Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms