Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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