Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PDK4Q16654 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PDK4Q16654 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PDK4Q16654 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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