Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms