Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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