Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms