Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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