Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms