Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms