Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms