Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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