Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms