Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms