Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKBKEQ14164 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKBKEQ14164 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms