Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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