Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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