Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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