Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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