Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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