Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTCH1Q13635 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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