Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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