Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms